Deti s epilepsiou majú zvýšené riziko autizmu, aj keď nie je úplne známe, aký je vzťah medzi týmito dvomi ochoreniami. Existuje tiež súvislosť medzi autizmom, poruchami učenia a epilepsiou. Liečba ľudí s epilepsiou a autizmom je rovnaká ako u tých, ktorí autizmus nemajú. Všetky testy potrebné na zistenie epilepsie však treba prispôsobiť ich stavu, aby vyšetrenia zvládli bez nadmerného stresu.
Lieky na epilepsiu, ktoré ľudia s autizmom užívajú, sú rovnaké ako u osôb bez autizmu.